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多組學研究識別出結直腸癌關鍵預后因子

2024-08-09 10:20:00  |  來 源:科技日報  點擊:

科技日報深圳8月8日電 (記者羅云鵬)8日,記者從深圳華大生命科學研究院獲悉,該院與瑞典烏普薩拉大學、華大基因智惠醫(yī)學研究院等合作,通過對瑞典1063例結直腸癌樣本進行全基因組及轉錄組測序分析,發(fā)現(xiàn)一系列與癌癥不同階段相關的基因。研究還識別出結直腸癌關鍵預后因子,為結直腸癌的預防、治療及預后提供了數(shù)據(jù)基礎。相關成果7日發(fā)表在《自然》上。

烏普薩拉大學教授托比亞斯·斯格羅姆認為,這項研究實現(xiàn)了迄今為止最大規(guī)模的結直腸癌基因組和轉錄組綜合分析,并將分子層面的發(fā)現(xiàn)與高質量的臨床數(shù)據(jù)相結合,從而識別出關鍵預后因子。這是與其他絕大多數(shù)癌癥基因組學研究的不同之處。

研究人員通過全基因組和轉錄組測序分析發(fā)現(xiàn),在線粒體基因組和非編碼區(qū)域中亦存在與疾病相關突變,填補了相關研究的空白,將進一步推動對結直腸癌發(fā)病機制的理解。

同時,研究團隊將同一腫瘤樣本基因組和轉錄組數(shù)據(jù)進行整合分析后發(fā)現(xiàn),無論是否為微衛(wèi)星不穩(wěn)定性腫瘤,其抑癌基因上的突變均導致基因表達降低,從而更容易患癌。

此外,研究團隊基于腫瘤基因表達差異,將結直腸癌預后分為5個預后亞型。相較于結直腸癌經(jīng)典的共識分子分型,本研究構建的亞型能更加準確地預測預后。

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